L’administration de l'Éducation nationale est présente dans chaque région et département : ce sont les services déconcentrés du ministère de l'Éducation nationale. Son organisation s'articule autour de 18 régions académiques, 30 académies et 97 directions des services départementaux de l'Éducation nationale.

Le recteur de la région académique La Réunion dispose d’un rôle renforcé : il assure le pilotage de missions stratégiques (carte des formations, enseignement supérieur, recherche, innovation, orientation, numérique éducatif...) dans différents champs de compétences intéressant la région et le préfet de région.

Pour cela, il a autorité sur l’ensemble du champ scolaire, de l’enseignement supérieur et de la recherche, ce qui permet ainsi d’assurer l’unité de la parole de l’État en ces domaines vis-à-vis des acteurs régionaux, qu’il s’agisse des autres services de l’État ou des collectivités territoriales.

L’objectif de cette évolution de l’organisation territoriale est de simplifier et d’améliorer la gouvernance des politiques éducatives, de formation, de recherche et d’innovation afin d’apporter un meilleur service aux élèves, aux familles et aux étudiants.